Nature Methods：里程碑突破！研究人员将百万碱基人类DNA植入小鼠胚胎，现场直播生命“开机”过程
这项研究为基础生命科学的探索打开了一扇全新的大门。我们终于有能力创造出完全“洁净”的遗传物质，去研究那些最根本的生命问题：染色体是如何组织和折叠的？基因组的稳定性和表达调控是如何从零开始建立的？
Nature Methods：从“猜”到“预见”——AI模型PUPS揭示单细胞蛋白质定位的秘密
PUPS作为一款结合蛋白质序列和细胞图像的新型AI模型，不仅能准确预测未知蛋白质在未知细胞系中的定位，还能揭示蛋白质定位在不同细胞系和单细胞层面的变异规律，甚至预测突变对定位的影响。
Nature Methods：解锁细胞宇宙的“星图”——scvi-hub如何将海量单细胞数据“浓缩”到你的笔记本电脑里？
如果说单细胞数据是浩瀚的宇宙，那么细胞图谱就是我们绘制的星图。scvi-hub所做的，就是将这幅无比庞大、复杂的星图，转化为一个轻便、智能、人人可用的“数字天文馆”。
Nature Methods：从“我猜”到“我证”的进化——当AI学会主动查资料，我们离“可信科研伙伴”更近一步
该研究介绍了一位全新的AI智能体——GeneAgent。它不仅仅是一个被动的知识问答机器，更是一个主动的探索者和验证者。
Nature Methods：西湖大学申怀宗/原发杰开发冷冻电镜AI基础模型，“一键式”洞见生命分子结构
该研究开发了用于冷冻电镜图像处理的 AI 基础模型——Cryo-IEF，并基于此构建了完全自动化的端到端“一键式”数据处理流程——CryoWizard。
Nature Methods：解锁植物细胞壁“功能地图”！“碳标签”——活体感知软硬、酸碱与信号
研究人员开发出一种名为“碳标签”（CarboTag）的创新模块化工具箱。它是一个巧妙的小分子，能够像“导航仪”一样精准、快速地将各种探针分子靶向并结合到活体植物及藻类的细胞壁上，且对细胞毒性极低。
Nature Methods：告别“猜谜”式研究！CellNEST为细胞通讯分析带来前所未有的精准度与深度
他们开发了一款名为CellNEST的全新计算工具，它如同一位装备了人工智能（AI）武器的顶尖侦探，能够以前所未有的精度和深度，揭示细胞世界的秘密。
Nature Methods：Paired-Damage-seq——同步解析DNA损伤与基因表达
研究人员开发了一种名为Paired-Damage-seq的全新技术，能够以前所未有的精度在单个细胞水平上同时分析氧化损伤和单链DNA损伤，并结合分析基因的表达情况。
Nature Methods：颠覆认知的疾病机制革命！
随着生命科学的不断进步，人类正在突破线性序列的桎梏。可以看到，一个全新的领域已然开启：也许未来的精准医疗，会从给每个患者的基因组绘制专属的“四维折叠地图”开始。
Nature Methods：蛋白质工程新范式！当AI开始“补习”第一性原理，METL框架从“知其然”到“知其所以然”
研究人员提出了一个名为“突变效应迁移学习”(Mutational Effect Transfer Learning, METL)的全新框架，巧妙地将经典的生物物理学模拟与前沿的深度学习相结合。