Nature Methods：药物发现的“大航海时代”！CIGS数据库或将成为新药研发的“超级加速器”
从CIGS数据库中的一个意外发现出发，研究人员成功揭示了女贞苷的现代身份——一个新的、可以直接结合并抑制BRD4功能的活性分子。这个案例完美地展示了CIGS数据库作为“创新引擎”的巨大潜力。
Nature Methods：“鱼”与“熊掌”兼得？！MAPIT-seq，同时绘制单细胞RBP-RNA互作图谱与表达谱
研究人员开发了一项名为MAPIT-seq的新技术，它如同一位能潜入细胞内部的“分子侦探”，不仅能精确绘制出特定RBP在原位与哪些RNA分子发生了接触，还能同时拍下整个细胞的基因表达“全景图”。
Nature Methods：颠覆认知的疾病机制革命！
随着生命科学的不断进步，人类正在突破线性序列的桎梏。可以看到，一个全新的领域已然开启：也许未来的精准医疗，会从给每个患者的基因组绘制专属的“四维折叠地图”开始。
Nature Methods：当百年病理学遇见AI——iSCALE赋能H&E图像，预测细胞级空间转录组
iSCALE 的诞生，为研究人员提供了一种全新的“世界观”和方法论，彻底改变了我们在大尺度上探索组织微观世界的游戏规则。
Nature Methods：告别“猜谜”式研究！CellNEST为细胞通讯分析带来前所未有的精准度与深度
他们开发了一款名为CellNEST的全新计算工具，它如同一位装备了人工智能（AI）武器的顶尖侦探，能够以前所未有的精度和深度，揭示细胞世界的秘密。
Nature Methods：里程碑突破！研究人员将百万碱基人类DNA植入小鼠胚胎，现场直播生命“开机”过程
这项研究为基础生命科学的探索打开了一扇全新的大门。我们终于有能力创造出完全“洁净”的遗传物质，去研究那些最根本的生命问题：染色体是如何组织和折叠的？基因组的稳定性和表达调控是如何从零开始建立的？
Nature Methods：从“我猜”到“我证”的进化——当AI学会主动查资料，我们离“可信科研伙伴”更近一步
该研究介绍了一位全新的AI智能体——GeneAgent。它不仅仅是一个被动的知识问答机器，更是一个主动的探索者和验证者。
Nature Methods：解锁细胞宇宙的“星图”——scvi-hub如何将海量单细胞数据“浓缩”到你的笔记本电脑里？
如果说单细胞数据是浩瀚的宇宙，那么细胞图谱就是我们绘制的星图。scvi-hub所做的，就是将这幅无比庞大、复杂的星图，转化为一个轻便、智能、人人可用的“数字天文馆”。
Nature Methods：当细胞开始“自白”，解码癌症基因的双面叙
DEFND-seq能够同时分析同一细胞核的DNA和RNA，研究人员能直接建立基因突变-表达表型-细胞功能的因果关系，为精准医疗提供全新工具。
Nature Methods：西湖大学申怀宗/原发杰开发冷冻电镜AI基础模型，“一键式”洞见生命分子结构
该研究开发了用于冷冻电镜图像处理的 AI 基础模型——Cryo-IEF，并基于此构建了完全自动化的端到端“一键式”数据处理流程——CryoWizard。